RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100237.3

Ttf1-201, Transcript of Transcription termination factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ttf1, Length 4,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trim65Q8BFW4 522 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Clasp2Q8BRT1 1286 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pak4Q8BTW9 593 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 AopepQ8BXQ6 817 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pex5lQ8C437 567 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Txndc5Q91W90 417 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NwcQ9CQI4 244 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Acot3Q9QYR7 432 aa7.27□□□□□ -1.24
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp31E9Q6Y8 1344 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ubr1O70481 1757 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Znf711A2ANX9 761 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Maml3D4QGC2 1135 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Hcn4O70507 1186 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mucl2P02815 138 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cap1P40124 474 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pax7P47239 503 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 VegfbP49766 207 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tatdn3Q3U1C6 294 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 E2f8Q58FA4 860 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Epha7Q61772 998 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 MtrrQ8C1A3 696 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tmem53Q9D0Z3 276 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CrebbpP45481 2441 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 FxnO35943 207 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ets2P15037 468 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Eno1P17182 434 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sesn2P58043 480 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NfixP70257 488 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PtprvP70289 1705 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lmntd2Q0VET5 664 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 BC051142Q3V0M8 400 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfp449Q8CB76 518 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zbtb8bQ8CII0 484 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Crlf2Q8CII9 359 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Acat1Q8QZT1 424 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mettl13Q91YR5 698 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trim7Q923T7 510 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc5a5Q99PN0 618 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pabpc6Q9D4E6 643 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Drc3Q9D5E4 523 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PycardQ9EPB4 193 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Strn3Q9ERG2 796 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ndel1Q9ERR1 345 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Extl3Q9WVL6 918 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 B3galt4Q9Z0F0 371 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Med1Q925J9 1575 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Apol8A2VDH7 339 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam47eD3YWC7 402 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam129cD3YZB0 591 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ccdc175E9PVB3 822 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Slc27a2O35488 620 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pik3r1P26450 724 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trim43bP86448 445 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Flt3Q00342 1000 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Runx2Q08775 607 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Palb2Q3U0P1 1104 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zbtb16Q3UQ17 673 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Foxn1Q61575 648 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sin3bQ62141 1098 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Senp6Q6P7W0 1132 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Arhgap10Q6Y5D8 786 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 TbataQ7TSD4 393 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Olfr805Q8VFI4 319 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Alg1Q921Q3 482 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tlr3Q99MB1 905 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ddx47Q9CWX9 455 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 MlklQ9D2Y4 472 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm3404Q9D506 307 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GgcxQ9QYC7 757 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Adam22Q9R1V6 904 aa7.27□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Erich2E9Q1A6 463 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cav1P49817 178 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Smyd1P97443 490 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pstpip1P97814 415 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GabpaQ00422 454 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nt5c2Q3V1L4 560 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Syne3Q4FZC9 975 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 PtprnQ60673 979 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Phc1Q64028 1012 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ankrd6Q69ZU8 712 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam20aQ8CID3 541 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Pdik1lQ8QZR7 341 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ero1aQ8R180 464 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Taf12Q8VE65 161 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Kiaa2013Q91X21 634 aa7.26□□□□□ -1.25
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms