RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LIN9Q5TKA1 542 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRT79Q5XKE5 535 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDXDC1Q6P996 788 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PARM1Q6UWI2 310 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ITFG1Q8TB96 612 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NXPE3Q969Y0 559 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UROC1Q96N76 676 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PNMA5Q96PV4 448 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLIN2Q99541 437 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAB34Q9BZG1 259 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MTRRQ9UBK8 725 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STK24Q9Y6E0 443 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CITO14578 2027 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PATJQ8NI35 1801 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WDR27A2RRH5 827 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LAD1O00515 517 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PODXLO00592 558 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HARSP12081 509 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RFX1P22670 979 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PROZP22891 400 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXA9P31269 272 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ROR1Q01973 937 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANGPT1Q15389 498 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SEZ6Q53EL9 994 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 XKR4Q5GH76 650 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPECC1Q5M775 1068 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HYIQ5T013 277 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MCTP1Q6DN14 999 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POTEHQ6S545 545 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALKAL1Q6UXT8 129 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FGF13Q92913 245 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SNX27Q96L92 541 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DRC1Q96MC2 740 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACAP3Q96P50 834 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TCHPQ9BT92 498 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDH7Q9ULB5 785 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DMDP11532 3685 aa6.48□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRAPPC3O43617 180 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 XYLBO75191 536 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRN2O75325 713 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RHOP08100 348 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 POU2F2P09086 479 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MCF2P10911 925 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLS3P13797 630 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNE1P15382 129 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GUCY2CP25092 1073 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GJB2P29033 226 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC12A3P55017 1021 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARPP19P56211 112 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPAG1Q07617 926 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STRN3Q13033 797 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RABEP1Q15276 862 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UVSSAQ2YD98 709 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms