RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 KBTBD2Q8IY47 623 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 GPR135Q8IZ08 494 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 KLHL36Q8N4N3 616 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ACRBPQ8NEB7 543 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CFHR4Q92496 578 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MRGPRX1Q96LB2 322 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SGCZQ96LD1 299 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MRI1Q9BV20 369 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ENKD1Q9H0I2 346 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNH6Q9H252 994 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 EPC1Q9H2F5 836 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SACM1LQ9NTJ5 587 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 STK32BQ9NY57 414 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CDC23Q9UJX2 597 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 NR2E1Q9Y466 385 aa2.77□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 POM121BA6NF01 834 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 F5H423 210 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MYO1FO00160 1098 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGAP6O43182 974 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 B4GALT3O60512 393 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PRSS23O95084 383 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CD1AP06126 327 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SETSIPP0DME0 302 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 IL2RBP14784 551 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 GYPEP15421 78 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCB4P21439 1286 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TNFSF4P23510 183 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNJ5P48544 419 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TRAPPC10P48553 1259 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CASP5P51878 434 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PTTG1IPP53801 180 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 NPEPPSP55786 919 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 WNT3AP56704 352 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SOX8P57073 446 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 LINC00310P59036 64 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 RAP2BP61225 183 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CTBP1Q13363 440 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 RAB39AQ14964 217 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNA10Q16322 511 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CSRP2Q16527 193 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ZMAT1Q5H9K5 638 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 C11orf96Q7Z7L8 435 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 REXO1L1PQ8IX06 675 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SYT8Q8NBV8 401 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 POF1BQ8WVV4 589 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 KIAA1191Q96A73 305 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PGBD4Q96DM1 585 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM176AQ96HP8 235 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PHACTR3Q96KR7 559 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 DPYSL5Q9BPU6 564 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRC27Q9C0I9 530 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF287Q9HBT7 754 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CD320Q9NPF0 282 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXO34Q9NWN3 711 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 OGDHLQ9ULD0 1010 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 AGAP1Q9UPQ3 857 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa2.76□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM233B4DJY2 109 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 BTN3A1O00481 513 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MTSS1O43312 755 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 NUAK1O60285 661 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PIP5K1CO60331 668 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 NOBOXO60393 691 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 NBNO60934 754 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ARIH2O95376 493 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MATN4O95460 622 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 ATP5JP18859 108 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SLC6A2P23975 617 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 HALP42357 657 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 STT3AP46977 705 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TM4SF4P48230 202 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 GZMKP49863 264 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CREMQ03060 361 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 STK3Q13188 491 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 SP140Q13342 867 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 RIN1Q13671 783 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM14Q14142 442 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 UBXN2BQ14CS0 331 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 TUBB8Q3ZCM7 444 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 GAGE13Q4V321 117 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 CCDC93Q567U6 631 aa2.75□□□□□ -1.97
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM26FQ5R3K3 315 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms