RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CPB2Q96IY4 423 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 HSPBP1Q9NZL4 362 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TLR3O15455 904 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TLE2Q04725 743 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ALS2CR12Q96Q35 445 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MMS19Q96T76 1030 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TCHPQ9BT92 498 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.54■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 DCDC2CA8MYV0 355 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SRGAP2O75044 1071 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TOM1L1O75674 476 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 GARTP22102 1010 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FAM26DQ5JW98 314 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 GANQ9H2C0 597 aa21.53■■□□□ 1.04
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CLN8-208ENST00000635751 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.53■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CLDN3O15551 220 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 EXOC3O60645 756 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CAND2O75155 1236 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 AKAP3O75969 853 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FAM193AP78312 1265 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MYBPC2Q14324 1141 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TERF2Q15554 542 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 IQCEQ6IPM2 695 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 WDR93Q6P2C0 686 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB33Q86T24 672 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FAM228AQ86W67 206 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 RDH13Q8NBN7 331 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CAGE1Q8TC20 777 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SAAL1Q96ER3 474 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TOX2Q96NM4 488 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ST7Q9NRC1 585 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 RPS6KA5O75582 802 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 MOCS3O95396 460 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 FAAP100Q0VG06 881 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 ZMYND15Q9H091 742 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 PTPRHQ9HD43 1115 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SNX12Q9UMY4 172 aa21.52■■□□□ 1.04
CLN8-208ENST00000635751 SCN5AQ14524 2016 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 ABLIM1O14639 778 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MAP2K7O14733 419 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PRLRP16471 622 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PROZP22891 400 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MCM3P25205 808 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 VSNL1P62760 191 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 HDXQ7Z353 690 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 AIPL1Q9NZN9 384 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.51■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 MYH10P35580 1976 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 TRIP11Q15643 1979 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 A0A0B4J269 797 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 A0A1B0GUA9 196 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 GHRP10912 638 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 BFSP2Q13515 415 aa21.5■■□□□ 1.03
CLN8-208ENST00000635751 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.5■■□□□ 1.03
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