RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR65	Q8IYL9	337 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	STAM	Q92783	540 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	B3GALT6	Q96L58	329 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXL18	Q96ME1	805 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	S1PR5	Q9H228	398 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNTN3	Q9P232	1028 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		18.08	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX28	O15482	410 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFEMP2	O95967	443 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLUD1	P00367	558 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXCL8	P10145	99 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CLCN4	P51793	760 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	POSTN	Q15063	836 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	UPP1	Q16831	310 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADAL	Q6DHV7	355 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM212A	Q96EL1	285 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPATA32	Q96LK8	384 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACCS	Q96QU6	501 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	FIZ1	Q96SL8	496 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	FNIP2	Q9P278	1114 aa		18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	18.07	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0B4J269	797 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PODXL	O00592	558 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTHFR	P42898	656 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALCAM	Q13740	583 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PALB2	Q86YC2	1186 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUSD6	Q92537	303 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF12	Q96FN5	646 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD320	Q9NPF0	282 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		18.06	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	REV3L	O60673	3130 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNFSF9	P41273	254 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASIC1	P78348	528 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMD5	Q16401	504 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RTP2	Q5QGT7	225 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD302	Q8IX05	232 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	18.05	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALAD	P13716	330 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPAG1	Q07617	926 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	E2F4	Q16254	413 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	RESP18	Q5W5W9	173 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM206	Q9H813	350 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0C4DFX4	3053 aa		18.04	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC26	A0AVF1	554 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	LACTBL1	A8MY62	500 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	C1R	P00736	705 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYB	P10242	640 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCM4	P33991	863 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRCC3	P46736	316 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACOT2	P49753	483 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	18.03	■□□□□ 0.48
JMJD1C-211	ENST00000633035	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		18.03	■□□□□ 0.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms