RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ATG7	O95352	703 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MME	P08473	750 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CETP	P11597	493 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GBP1	P32455	592 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PDE6C	P51160	858 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KCNH2	Q12809	1159 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SEC14L1	Q92503	715 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CEP170P1	Q96L14	293 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		16.39	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ATP8B3	O60423	1300 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PDLIM1	O00151	329 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PGK2	P07205	417 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MMP13	P45452	471 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CASP4	P49662	377 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GTF2A2	P52657	109 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PRKCE	Q02156	737 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SCFD2	Q8WU76	684 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ACCS	Q96QU6	501 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM206	Q9H813	350 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	RRAGC	Q9HB90	399 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DMAC2	Q9NW81	257 aa		16.38	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC169	A6NNP5	214 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659		F8VZ95	297 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	EPHB6	O15197	1021 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PALM	O75781	387 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NUDT17	P0C025	328 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TGFB3	P10600	412 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CYP2C8	P10632	490 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PPP2R5E	Q16537	467 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	XKR3	Q5GH77	459 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BICD1	Q96G01	975 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FGD4	Q96M96	766 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM24	O75264	130 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NCKAP1L	P55160	1127 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PEX3	P56589	373 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	NCALD	P61601	193 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GTF2B	Q00403	316 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MYBPC2	Q14324	1141 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TAF11	Q15544	211 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	GALNTL6	Q49A17	601 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	WDR78	Q5VTH9	848 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PDXDC1	Q6P996	788 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	KIFAP3	Q92845	792 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF302	Q9NR11	478 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PDHX	O00330	501 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SOCS7	O14512	581 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	DGAT1	O75907	488 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SERPING1	P05155	500 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	COPS2	P61201	443 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CCL15	Q16663	113 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	FBF1	Q8TES7	1133 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	BORCS6	Q96GS4	357 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM7	Q9C029	511 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		16.36	■□□□□ 0.21
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC42	Q9Y546	428 aa		16.36	■□□□□ 0.21

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