RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 FAM213AQ9BRX8 229 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 PARP2Q9UGN5 583 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.28□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 KRT5P13647 590 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 GBP1P32455 592 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 GTF2H1P32780 548 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CXCL9Q07325 125 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MFSD5Q6N075 450 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 GPD1LQ8N335 351 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 TTLL6Q8N841 843 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.27□□□□□ -0.12
C9orf170-201ENST00000623052 VWA5AO00534 786 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 VNN1O95497 513 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SCTRP47872 440 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SMTNP53814 917 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CNGA2Q16280 664 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SGO2Q562F6 1265 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC25Q86WR0 208 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 REPS2Q8NFH8 660 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CEP170P1Q96L14 293 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.27□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SORBS3O60504 671 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CLDN10P78369 228 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SLMAPQ14BN4 828 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MON1BQ7L1V2 547 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 WHRNQ9P202 907 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 RASGRF2O14827 1237 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ACSL3O95573 720 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 EDN1P05305 212 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ACO1P21399 889 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MAPK4P31152 587 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PTK6Q13882 451 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KIFAP3Q92845 792 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DCLK3Q9C098 648 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 HAUS2Q9NVX0 235 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 H0YHG0 523 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CETPP11597 493 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SCP2P22307 547 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DSG3P32926 999 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 VSTM1Q6UX27 236 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TAS2R40P59535 323 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CENPCQ03188 943 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R7Q15435 360 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 RNF146Q9NTX7 359 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 GJB6O95452 261 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 NR3C2P08235 984 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 DPEP1P16444 411 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 FAM228AQ86W67 206 aa14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ATP2C2O75185 946 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 GARTP22102 1010 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 IFNAR2P48551 515 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ITGA8P53708 1063 aa14.24□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PRKCEQ02156 737 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms