RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.61□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.61□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 CNTN3Q9P232 1028 aa14.61□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.61□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 GLUD1P00367 558 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 KCNE1P15382 129 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 EPCAMP16422 314 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 CLCNKBP51801 687 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 ZP2Q05996 745 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 NAB2Q15742 525 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 XKR4Q5GH76 650 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 GPR65Q8IYL9 337 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 STAMQ92783 540 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 B3GALT6Q96L58 329 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 FBXL18Q96ME1 805 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 ACCSQ96QU6 501 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 FIZ1Q96SL8 496 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 TTPALQ9BTX7 342 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 CHST7Q9NS84 486 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 A0A0B4J269 797 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 PODXLO00592 558 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 TEX28O15482 410 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 EFEMP2O95967 443 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 CLCN4P51793 760 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 ASIC1P78348 528 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 POSTNQ15063 836 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 UPP1Q16831 310 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 ADALQ6DHV7 355 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 FAM212AQ96EL1 285 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 KIF12Q96FN5 646 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SENP3-209ENST00000610454 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 LILRB3O75022 631 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 TNFSF9P41273 254 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 MTHFRP42898 656 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 E2F4Q16254 413 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 PSMD5Q16401 504 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 RTP2Q5QGT7 225 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 RESP18Q5W5W9 173 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 CD302Q8IX05 232 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 MAN1C1Q9NR34 630 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 FNIP2Q9P278 1114 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 PLXNA3P51805 1871 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 TTC26A0AVF1 554 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 PPP1R37O75864 691 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 MCM4P33991 863 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 PALB2Q86YC2 1186 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 SUSD6Q92537 303 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 TRIM9Q9C026 710 aa14.57□□□□□ -0.08
SENP3-209ENST00000610454 S1PR5Q9H228 398 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms