RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 BICDL2A1A5D9 508 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 MAPK13O15264 365 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 SLC11A1P49279 550 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 SPAG1Q07617 926 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CYP24A1Q07973 514 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 PAK1Q13153 545 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 JADE1Q6IE81 842 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 KIF12Q96FN5 646 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF558Q96NG5 402 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 MED15Q96RN5 788 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 PDE11AQ9HCR9 933 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 RWDD2AQ9UIY3 292 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 NRP1O14786 923 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CETN3O15182 167 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 AKAP3O75969 853 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 NFICP08651 508 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CYP3A5P20815 502 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 PBX3P40426 434 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 PSMD6Q15008 389 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 SURF1Q15526 300 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CEP135Q66GS9 1140 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 NT5DC4Q86YG4 428 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CERS4Q9HA82 394 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 SPG21Q9NZD8 308 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 MTUS1Q9ULD2 1270 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 CTNND2Q9UQB3 1225 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 FAN1Q9Y2M0 1017 aa19.15■□□□□ 0.66
ZNF548-204ENST00000594693 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 RPL9P32969 192 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CTNNB1P35222 781 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 STX17P56962 302 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM132DQ14C87 1099 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF697Q5TEC3 545 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 SPATA1Q5VX52 437 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 EFCAB13Q8IY85 973 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 SLC39A11Q8N1S5 342 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 KLHL23Q8NBE8 558 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 ARNTL2Q8WYA1 636 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 EEF2KMTQ96G04 330 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 BORCS6Q96GS4 357 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 UROC1Q96N76 676 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 PAAF1Q9BRP4 392 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 MKNK1Q9BUB5 465 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CHD7Q9P2D1 2997 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 DACH1Q9UI36 760 aa19.14■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 EPOPA6NHQ4 379 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CASTOR2A6NHX0 329 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 H3BNC9 293 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 XPOTO43592 962 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 LRPAP1P30533 357 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 PPM1AP35813 382 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 OR1G1P47890 313 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CLDN10P78369 228 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 PLCB3Q01970 1234 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 GRIN2CQ14957 1233 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 UPP1Q16831 310 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 FBXO22Q8NEZ5 403 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 PLEKHO2Q8TD55 490 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 PARD3BQ8TEW8 1205 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 IGSF21Q96ID5 467 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CEP63Q96MT8 703 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 COLEC11Q9BWP8 271 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 ANO10Q9NW15 660 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CACNG4Q9UBN1 327 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CITO14578 2027 aa19.13■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 FGF18O76093 207 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 EFEMP2O95967 443 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 ITGB1P05556 798 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CLCNKBP51801 687 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 ENPEPQ07075 957 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CD300LGQ6UXG3 332 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 FAM186BQ8IYM0 893 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 BEST2Q8NFU1 509 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 SPPL3Q8TCT6 385 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 TMC2Q8TDI7 906 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 RABGGTAQ92696 567 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC127Q96BQ5 260 aa19.12■□□□□ 0.65
ZNF548-204ENST00000594693 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms