RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 UPP1Q16831 310 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5DC1Q5TFE4 455 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 ATF7IP2Q5U623 682 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CD300LGQ6UXG3 332 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 RMDN1Q96DB5 314 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 IFT74Q96LB3 600 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 UROC1Q96N76 676 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 KXD1Q9BQD3 176 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 BACE2Q9Y5Z0 518 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAPPC3O43617 180 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 NEK4P51957 841 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 GUCY1B3Q02153 619 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF174Q15697 407 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ECM1Q16610 540 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF528Q3MIS6 628 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ING5Q8WYH8 240 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 RUBCNQ92622 972 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 KIFAP3Q92845 792 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 HINFPQ9BQA5 517 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 BCO2Q9BYV7 579 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CITO14578 2027 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM170BA6NMN3 283 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 I3L4J1 428 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 LAMTOR5O43504 91 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 KINO60870 393 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ECI2O75521 394 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOP08100 348 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEA9P43362 315 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 BRCC3P46736 316 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP120Q8N960 986 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF461Q8TAF7 563 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 BORCS6Q96GS4 357 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 POLD4Q9HCU8 107 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 GDE1Q9NZC3 331 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 K7ERI5 159 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SPTLC1O15269 473 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ABLIM3O94929 683 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CD72P21854 359 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 GRM5P41594 1212 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.69e-7■■□□□ 11.7
EFTUD2-226ENST00000593200 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ROR1Q01973 937 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 XKR4Q5GH76 650 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC38Q5R3I4 469 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 POTEHQ6S545 545 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ALKAL1Q6UXT8 129 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 DCLK2Q8N568 766 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf76Q96K31 380 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CDT1Q9H211 546 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRHQ9HD43 1115 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR27A2RRH5 827 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC169A6NNP5 214 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 PODXLO00592 558 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 SYN3O14994 580 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 TBC1D4O60343 1298 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 LRG1P02750 347 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-226ENST00000593200 ATF2P15336 505 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms