RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ESYT3A0FGR9 886 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 DENND3A2RUS2 1198 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FGGP02679 453 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 MYZAPP0CAP1 466 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GARTP22102 1010 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 USP8P40818 1118 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GPC3P51654 580 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCY2FP51841 1108 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BACE1P56817 501 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PTENP60484 403 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK-9P63128 1117 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PPATQ06203 517 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BIRC3Q13489 604 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 UGCGQ16739 394 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 CROCCP2Q86T23 111 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM71AQ8IYT1 594 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 LMO3Q8TAP4 145 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP170P1Q96L14 293 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM117Q9H0C3 514 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ACAD9Q9H845 621 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf112Q9NSG2 853 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 USTQ9Y2C2 406 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.89□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP2A1O14983 1001 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PHF2O75151 1096 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 UPP2O95045 317 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNE2O96020 404 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 MYBL1P10243 752 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRNA3P32297 505 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 NPTX2P47972 431 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BPIFB4P59827 614 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 DR1Q01658 176 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GCNT1Q02742 428 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP3CAQ08209 521 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 STRN3Q13033 797 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 VSIG10LQ86VR7 867 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 HOOK3Q86VS8 718 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF677Q86XU0 584 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCKQ8N0W5 287 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GPD1LQ8N335 351 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 OLIG1Q8TAK6 271 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC14L1Q92503 715 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SHC3Q92529 594 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ATG4CQ96DT6 458 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 BICD1Q96G01 975 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP89Q96ST8 783 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ZSWIM1Q9BR11 485 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 THAP2Q9H0W7 228 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 IKZF4Q9H2S9 585 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 HACL1Q9UJ83 578 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 MYH10P35580 1976 aa9.88□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 PODXLO00592 558 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 SPOPO43791 374 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 ZEB2O60315 1214 aa9.87□□□□□ -0.83
EFTUD2-222ENST00000592408 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms