RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 RAD54LQ92698 747 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 EPSTI1Q96J88 318 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 RIPOR3Q96MK2 946 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CLIC6Q96NY7 704 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 EPAS1Q99814 870 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SFXN1Q9H9B4 322 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C17orf75Q9HAS0 396 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 IRAK3Q9Y616 596 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TEX28O15482 410 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 GRM5P41594 1212 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 MTHFRP42898 656 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LIG4P49917 911 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CLCN4P51793 760 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 DSG1Q02413 1049 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC15Q8TF66 581 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC22A17Q8WUG5 538 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ADAM7Q9H2U9 754 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 KCND2Q9NZV8 630 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC39Q9UFE4 941 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 MTMR6Q9Y217 621 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NR2E1Q9Y466 385 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CITO14578 2027 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 I3L4J1 428 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC26A4O43511 780 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 B3GAT3O94766 335 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 MCF2P10911 925 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CLCNKBP51801 687 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 STK38Q15208 465 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PTPAQ15257 358 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PSMD5Q16401 504 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ARSHQ5FYA8 562 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 RTP2Q5QGT7 225 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ATAT1Q5SQI0 421 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 USP49Q70CQ1 688 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 DYMQ7RTS9 669 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SNX27Q96L92 541 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ACAP3Q96P50 834 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 USP28Q96RU2 1077 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PARVGQ9HBI0 331 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C11orf16Q9NQ32 467 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 C2CD4DB7Z1M9 353 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 H0YCG3 227 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CLDN3O15551 220 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TOM1L1O75674 476 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 STAT6P42226 847 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 NCKAP1LP55160 1127 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CREMQ03060 361 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SPAG1Q07617 926 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 DDX12PQ92771 950 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TTPALQ9BTX7 342 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PANK2Q9BZ23 570 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PIDD1Q9HB75 910 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 PODXLO00592 558 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TGM5O43548 720 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAK2O60296 914 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 GPR37L1O60883 481 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-209ENST00000587957 LILRB3O75022 631 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms