RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 RHBDL3P58872 404 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SNAPC2Q13487 334 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 DACT2Q5SW24 774 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SEM1Q6ZVN7 128 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 FAM83AQ86UY5 434 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 FUKQ8N0W3 1084 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 DNERQ8NFT8 737 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 PPP1R35Q8TAP8 253 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 RAB24Q969Q5 203 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.06□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 MFAP3LO75121 409 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 HOXA5P20719 270 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ALDH1A3P47895 512 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 BIRC2Q13490 618 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ATP2B3Q16720 1220 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 C4orf46Q504U0 113 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 MRI1Q9BV20 369 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 EPC1Q9H2F5 836 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 L1RE1Q9UN81 338 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.05□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 FAM227AF5H4B4 570 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ZBED1O96006 694 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 USP14P54578 494 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 CLRN1P58418 232 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ST8SIA2Q92186 375 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 TTC17Q96AE7 1141 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 WDCPQ9H6R7 721 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.04□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 A6NNZ2 444 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 RAP2AP10114 183 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 TYRP14679 529 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ATP5JP18859 108 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 GNAT2P19087 354 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 SMARCA1P28370 1054 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 GPSM2P81274 684 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 GALEQ14376 348 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 WDR78Q5VTH9 848 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ANKS6Q68DC2 871 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 NPNTQ6UXI9 565 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 DAAM2Q86T65 1068 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ANKRD35Q8N283 1001 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 D2HGDHQ8N465 521 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 Q8TCH9 128 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 MIEF2Q96C03 454 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 TIFAQ96CG3 184 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 PNPOQ9NVS9 261 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.03□□□□□ -1.28
TSG101-211ENST00000580814 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TSG101-211ENST00000580814 CCER2I3L3R5 266 aa7.02□□□□□ -1.29
TSG101-211ENST00000580814 AMHP03971 560 aa7.02□□□□□ -1.29
TSG101-211ENST00000580814 MYBP10242 640 aa7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms