RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYO15AQ9UKN7 3530 aa30.94■■■□□ 2.54
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCL16O15467 120 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAPPC3O43617 180 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HARSP12081 509 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CA14Q9ULX7 337 aa30.93■■■□□ 2.54
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa30.92■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNX27Q96L92 541 aa30.92■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ACAP3Q96P50 834 aa30.92■■■□□ 2.54
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DTWD2Q8NBA8 298 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITFG1Q8TB96 612 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FGF14Q92915 247 aa30.86■■■□□ 2.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DMDP11532 3685 aa30.85■■■□□ 2.53
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