RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566915.5

LPCAT2-208, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, human

TSL 1 (best)

Gene LPCAT2, Length 5,285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPCAT2-208	ENST00000566915	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	GPS1	Q13098	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMED1	Q13445	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PI16	Q6UXB8	463 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	JAML	Q86YT9	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	POTEM	A6NI47	508 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CETP	P11597	493 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GZMA	P12544	262 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RARG	P13631	454 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GNA15	P30679	374 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	FMO5	P49326	533 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GALC	P54803	685 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	MTMR1	Q13613	665 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF699	Q32M78	642 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	WHRN	Q9P202	907 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PAK5	Q9P286	719 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915		E9PMD0	336 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	MEIS1	O00470	390 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCYT1A	P49585	367 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NEK2	P51955	445 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NCAPH	Q15003	741 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RASSF3	Q86WH2	238 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RIT2	Q99578	217 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CHP1	Q99653	195 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.59	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	COBL	O75128	1261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	DGAT1	O75907	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMCC1	O94876	653 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	POTEI	P0CG38	1075 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CNTF	P26441	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GTF2H1	P32780	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GCLM	P48507	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	GTF2A2	P52657	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	DYNLT1	P63172	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68

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