RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563628.6

DYNC1LI2-205, Transcript of dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 2, human

TSL 5

Gene DYNC1LI2, Length 355 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ATP5J	P18859	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	PER3	P56645	1201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SP140	Q13342	867 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	DHCR24	Q15392	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RNF180	Q86T96	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GPANK1	O95872	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	C1R	P00736	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GCSH	P23434	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	PCSK1	P29120	753 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SCAND1	P57086	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SESN3	P58005	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	TTC1	Q99614	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ULK1	O75385	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	POMC	P01189	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RARRES1	P49788	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	NOMO3	P69849	1222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SEPT2	Q15019	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GREM2	Q9H772	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	CDK4	P11802	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	IL2RB	P14784	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SLC6A9	P48067	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	FATE1	Q969F0	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	OSM	P13725	252 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DYNC1LI2-205	ENST00000563628	VAV2	P52735	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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