RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOMO2Q5JPE7 1267 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABI1Q8IZP0 508 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMC2Q8TDI7 906 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF12Q96FN5 646 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 FNBP1Q96RU3 617 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBSNQ9H1K0 784 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP1A3P13637 1013 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 SURF1Q15526 300 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF516Q92618 1163 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CGRRF1Q99675 332 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 THP07101 528 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNNI1P19237 187 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAB2Q15742 525 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB6Q15916 424 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 URGCPQ8TCY9 931 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC35C1Q96A29 364 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 HCSTQ9UBK5 93 aa20.22■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GUCY2FP51841 1108 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLDN10P78369 228 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP3CAQ08209 521 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF280BQ86YH2 543 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 WDR49Q8IV35 697 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 YME1L1Q96TA2 773 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRO3102Q9H379 93 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 INTS13Q9NVM9 706 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 DERAQ9Y315 318 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 C2CD2Q9Y426 696 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GBF1Q92538 1859 aa20.21■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 B4GALT3O60512 393 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDHD2O94830 711 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 RABGGTBP53611 331 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ENPEPQ07075 957 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRIK3Q13003 919 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT31Q15323 416 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 GCLMP48507 274 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP37Q86T82 979 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAD9AQ99638 391 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 INSL6Q9Y581 213 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TLL1O43897 1013 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TPM4P67936 248 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNH2Q12809 1159 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAN2A1Q16706 1144 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 TDHQ8IZJ6 230 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC43Q8N309 656 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms