RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PPLO60437 1756 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 BCL9O00512 1426 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 BRINP1O60477 761 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 IGSF3O75054 1194 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ACRV1P26436 265 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 NRG3P56975 720 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PPARAQ07869 468 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 MIEF2Q96C03 454 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PRAM1Q96QH2 718 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF341Q9BYN7 854 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 NHSQ6T4R5 1651 aa6.57□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CYP27B1O15528 508 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 MTSS1O43312 755 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 FSHBP01225 129 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 LPLP06858 475 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 C6P13671 934 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 LGALS4P56470 323 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 MGAT5Q09328 741 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 UGT8Q16880 541 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 IL17DQ8TAD2 202 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.56□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 BTAF1O14981 1849 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 A0A1W2PR48 441 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 MFAP3LO75121 409 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CPEP16870 476 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 TACR2P21452 398 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CNGA1P29973 690 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 LBX1P52954 281 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 SPIDRQ14159 915 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 STAT4Q14765 748 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 UBE3CQ15386 1083 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 MFSD5Q6N075 450 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 KRT26Q7Z3Y9 468 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF503Q96F45 646 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CSRNP2Q9H175 543 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 USP6P35125 1406 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CPDO75976 1380 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 EYA4O95677 639 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CASRP41180 1078 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 DGCR2P98153 550 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CRHR2Q13324 411 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 IQSEC1Q6DN90 963 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CMIPQ8IY22 773 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 Q8N1X5 172 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 ACAP3Q96P50 834 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 VTA1Q9NP79 307 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 EXOC5O00471 708 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 NRP1O14786 923 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 STC2O76061 302 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 RGS19P49795 217 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 SCNN1GP51170 649 aa6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
ATXN3-218ENST00000553309 MIIPQ5JXC2 388 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms