RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 KCNH3Q9ULD8 1083 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MIA3Q5JRA6 1907 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 I3L4J1 428 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 K7ERI5 159 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 LAMTOR5O43504 91 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CD72P21854 359 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MUTP22033 750 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 BRCC3P46736 316 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CD300LGQ6UXG3 332 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 RTL10Q7L3V2 364 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 RUBCNQ92622 972 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 KIFAP3Q92845 792 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 MCRS1Q96EZ8 462 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 COL4A3Q01955 1670 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 KINO60870 393 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ELF1P32519 619 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ST3GAL1Q11201 340 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ECM1Q16610 540 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 DCLK2Q8N568 766 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 C8orf76Q96K31 380 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CCDC169A6NNP5 214 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 LRG1P02750 347 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 RHOP08100 348 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 PTPN2P17706 415 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 OSTNP61366 133 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 TTC38Q5R3I4 469 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CEP120Q8N960 986 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 FBXO4Q9UKT5 387 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 TNFSF13BQ9Y275 285 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 TRIP11Q15643 1979 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 NOTCH4Q99466 2003 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ZNF292O60281 2723 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ECI2O75521 394 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 GRM5P41594 1212 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ARPP19P56211 112 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 PEX3P56589 373 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ROR1Q01973 937 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 CDT1Q9H211 546 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 GDE1Q9NZC3 331 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-214ENST00000548849 PODXLO00592 558 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 PRRG1O14668 218 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 NCAM2O15394 837 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 MAGEA9P43362 315 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.572e-6■□□□□ 8.3
CS-214ENST00000548849 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 SUMF1Q8NBK3 374 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 NELL2Q99435 816 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.64■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 WDR27A2RRH5 827 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 CEBPBP17676 345 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 NPTX2P47972 431 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 XKR4Q5GH76 650 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.63■□□□□ 0.57
CS-214ENST00000548849 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms