RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 GFRA3O60609 400 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 MCF2P10911 925 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 NBR1Q14596 966 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 IL17AQ16552 155 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 LIN9Q5TKA1 542 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SIX5Q8N196 739 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CDT1Q9H211 546 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 F5P12259 2224 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 KRBA1A5PL33 1030 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 XYLBO75191 536 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 B3GAT3O94766 335 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 C8AP07357 584 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SCP2P22307 547 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RABEP1Q15276 862 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CNTN3Q9P232 1028 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 FBXL21Q9UKT6 434 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CDH7Q9ULB5 785 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 USP20Q9Y2K6 914 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 GDAQ9Y2T3 454 aa20.47■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 E9PMD0 336 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SYN3O14994 580 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ADAM12O43184 909 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PI15O43692 258 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 TBC1D4O60343 1298 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 HIP1RO75146 1068 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 FSHRP23945 695 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 CLCNKBP51801 687 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PEX3P56589 373 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 HASPINQ8TF76 798 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 SNX27Q96L92 541 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.46■□□□□ 0.87
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ABLIM3O94929 683 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 OR1D2P34982 312 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ZPBP2Q6X784 338 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MTSS1LQ765P7 747 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 KCNK18Q7Z418 384 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CEP57Q86XR8 500 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 DTWD2Q8NBA8 298 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 KMT5AQ9NQR1 393 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 MAFFQ9ULX9 164 aa20.45■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PRR23AA6NEV1 266 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CCDC169A6NNP5 214 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TOM1L1O75674 476 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 STARD6P59095 220 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CEP120Q8N960 986 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 FLCNQ8NFG4 579 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 FGF13Q92913 245 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.44■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PP2D1A8MPX8 630 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PLS3P13797 630 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 GPR152Q8TDT2 470 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 AK8Q96MA6 479 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ACAP3Q96P50 834 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 POLD4Q9HCU8 107 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF3Q9NR81 526 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 CACNA1AO00555 2505 aa20.43■□□□□ 0.86
LTBR-211ENST00000543190 PATJQ8NI35 1801 aa20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms