RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 FETUBQ9UGM5 382 aa11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 GTF3C4Q9UKN8 822 aa11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PHF24Q9UPV7 400 aa11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.51□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD63C9JTQ0 380 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CAPN9O14815 690 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 KCNQ2O43526 872 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ENTPD5O75356 428 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CIB2O75838 187 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CYP1A2P05177 515 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PRDX5P30044 214 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SLC1A1P43005 524 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 MAGEA8P43361 318 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SERPINB4P48594 390 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CDK8P49336 464 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC3Q13217 504 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 GJB7Q6PEY0 223 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 FAM20AQ96MK3 541 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SNED1Q8TER0 1413 aa11.5□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ATP2A1O14983 1001 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CAMTA2O94983 1202 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TGDSO95455 350 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CREB1P16220 341 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CETN2P41208 172 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CASP5P51878 434 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 XIAPP98170 497 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 EVX2Q03828 476 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TRIM11Q96F44 468 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 MAML3Q96JK9 1138 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 HAPLN3Q96S86 360 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 NDNQ99608 321 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SPATA16Q9BXB7 569 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 OSBPL8Q9BZF1 889 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 GPR88Q9GZN0 384 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 UBA5Q9GZZ9 404 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PIDD1Q9HB75 910 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CYLDQ9NQC7 956 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TM9SF1O15321 606 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 GSC2O15499 205 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 EDIL3O43854 480 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 MAGEC1O60732 1142 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 FAM13AO94988 1023 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SNHG28P0DPA3 235 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 KRT15P19012 456 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 HSPA1LP34931 641 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 HOXD13P35453 343 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CHKAP35790 457 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CASP4P49662 377 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CDK7P50613 346 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 RAP1GDS1P52306 607 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 AP2B1P63010 937 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ARHGAP4P98171 946 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 DSG1Q02413 1049 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PTP4A2Q12974 167 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ITGA9Q13797 1035 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TBCCQ15814 346 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SLF2Q8IX21 1173 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 UCMAQ8WVF2 138 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 COA7Q96BR5 231 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CEP95Q96GE4 821 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 IWS1Q96ST2 819 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 GPAMQ9HCL2 828 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 KCND2Q9NZV8 630 aa11.49□□□□□ -0.57
LMO3-215ENST00000537304 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms