RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536107.5

YBX3-205, Transcript of Y-box binding protein 3, human

TSL 2

Gene YBX3, Length 438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
YBX3-205	ENST00000536107	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PARP2	Q9UGN5	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TRIO	O75962	3097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MAST4	O15021	2626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	RLF	Q13129	1914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	C19orf81	C9J6K1	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MBTPS2	O43462	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NCK2	O43639	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	STRN	O43815	780 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	B4GALT4	O60513	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ENTPD3	O75355	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	BRD1	O95696	1058 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NTRK1	P04629	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ASGR1	P07306	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	LMO1	P25800	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PTH1R	Q03431	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CLC	Q05315	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PSMD2	Q13200	908 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NRN1L	Q496H8	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	RUBCN	Q92622	972 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TECTA	O75443	2155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CNMD	O75829	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CD4	P01730	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CD247	P20963	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ERVK-21	P61565	698 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PLS1	Q14651	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	FEZ1	Q99689	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	AURKA	O14965	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ITGA4	P13612	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ERCC3	P19447	782 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NDUFV1	P49821	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	GPM6B	Q13491	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	GCKR	Q14397	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	RAD9A	Q99638	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107		R4GN57	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YBX3-205	ENST00000536107	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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