RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 GPR149Q86SP6 731 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 RABGGTAQ92696 567 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX12PQ92771 950 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 HVCN1Q96D96 273 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CLCNKBP51801 687 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 RTP2Q5QGT7 225 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 HASPINQ8TF76 798 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CUEDC2Q9H467 287 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 USTQ9Y2C2 406 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 OGTO15294 1046 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CUTAO60888 179 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 FGFR3P22607 806 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 B3GALT6Q96L58 329 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 POMKQ9H5K3 350 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CITO14578 2027 aa20.12■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A0B4J269 797 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TTC26A0AVF1 554 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MYMKA6NI61 221 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PODXLO00592 558 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PSMD5Q16401 504 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 LILRA6Q6PI73 481 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 DYMQ7RTS9 669 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP57Q86XR8 500 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CD302Q8IX05 232 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CFAP45Q9UL16 551 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIP11Q15643 1979 aa20.11■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIOO75962 3097 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PRR33A8MZF0 331 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TGM5O43548 720 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM189A1O60320 539 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ADRB2P07550 413 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CYP3A5P20815 502 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ALCAMQ13740 583 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SFR1Q86XK3 245 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 LRFN3Q9BTN0 628 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TNMDQ9H2S6 317 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.1■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A087X0B3 334 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SYN3O14994 580 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP1R37O75864 691 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CXCL8P10145 99 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 POSTNQ15063 836 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 RTL10Q7L3V2 364 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PALB2Q86YC2 1186 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 EDAQ92838 391 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 STRA6Q9BX79 667 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MTRRQ9UBK8 725 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.09■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 LRPAP1P30533 357 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 AMPD3Q01432 767 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB6Q15916 424 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SEZ6Q53EL9 994 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 IQUBQ8NA54 791 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms