RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.2■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.2■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 KINO60870 393 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 RPA1P27694 616 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MAGEA9P43362 315 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.982e-13■□□□□ 9.2
RPS20-210ENST00000523936 PPP2R5AQ15172 486 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 DCLK2Q8N568 766 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 HINFPQ9BQA5 517 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 KXD1Q9BQD3 176 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 LTB4R2Q9NPC1 389 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 GDAQ9Y2T3 454 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 FAM170BA6NMN3 283 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 LAMTOR5O43504 91 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 B3GAT3O94766 335 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MCM7P33993 719 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 CLCNKBP51801 687 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 TRIM29Q14134 588 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 UPP1Q16831 310 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 DEPTORQ8TB45 409 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 UROC1Q96N76 676 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 F5P12259 2224 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 NCOR2Q9Y618 2525 aa21.18■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 SPTLC1O15269 473 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 JAK2O60674 1132 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ECI2O75521 394 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MUTP22033 750 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 EFNA5P52803 228 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 GLRA4Q5JXX5 417 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ERMNQ8TAM6 284 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 CLDN23Q96B33 292 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 GDE1Q9NZC3 331 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 COL4A2P08572 1712 aa21.17■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 TRAPPC3O43617 180 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 LIG1P18858 919 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 CD72P21854 359 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 POTEHQ6S545 545 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ING5Q8WYH8 240 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 NELL1Q92832 810 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 NELL2Q99435 816 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 KIF2CQ99661 725 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.16■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 RHOP08100 348 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 FOSBP53539 338 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.15■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 MYH11P35749 1972 aa21.14■□□□□ 0.98
RPS20-210ENST00000523936 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 ABLIM3O94929 683 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 OR52Z1P0C646 297 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 PTPN2P17706 415 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 BRCC3P46736 316 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 ROR1Q01973 937 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 RABEP1Q15276 862 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 XKR4Q5GH76 650 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 KIFAP3Q92845 792 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 IFT74Q96LB3 600 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.14■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 SHISA7A6NL88 538 aa21.13■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 I3L4J1 428 aa21.13■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 NCAM2O15394 837 aa21.13■□□□□ 0.97
RPS20-210ENST00000523936 LILRB5O75023 590 aa21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms