RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 INTUQ9ULD6 942 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DNM3Q9UQ16 869 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ATP10AO60312 1499 aa5.07□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PTPRTO14522 1441 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 NARSO43776 548 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 GNAT2P19087 354 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DSC2Q02487 901 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 IL10RAQ13651 578 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ACAP2Q15057 778 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 AFMIDQ63HM1 303 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FAM83AQ86UY5 434 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 RNF169Q8NCN4 708 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ADI1Q9BV57 179 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 GPRC5BQ9NZH0 403 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ACTL7AQ9Y615 435 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC78A2IDD5 438 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 B5MCH6 92 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CYP27B1O15528 508 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MFAP3LO75121 409 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PTPN7P35236 360 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ALDH1A3P47895 512 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 SP140Q13342 867 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 Q6ZPA2 131 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 AFAP1Q8N556 730 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 RAB24Q969Q5 203 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PRXQ9BXM0 1461 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 LTBP4Q8N2S1 1624 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC154A6NI56 674 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF185O15231 689 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PJA2O43164 708 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FAM20BO75063 409 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PRSS23O95084 383 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PDGFRBP09619 1106 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A4P31645 630 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 HSPA1LP34931 641 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ACVRL1P37023 503 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 RABL3Q5HYI8 236 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 IFI44Q8TCB0 444 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MRGPRX4Q96LA9 322 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 NDC1Q9BTX1 674 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MRI1Q9BV20 369 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 VPS11Q9H270 941 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DKK2Q9UBU2 259 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 SPEF1Q9Y4P9 236 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 C3P01024 1663 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 SAMD9Q5K651 1589 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 DRGXA6NNA5 263 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 NPIPB8E9PQR5 432 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ENDOD1O94919 500 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 TACR2P21452 398 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 NEK2P51955 445 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CLRN1P58418 232 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZXDAP98168 799 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 MCL1Q07820 350 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CRHR2Q13324 411 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM240Q5SV17 173 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PRR18Q8N4B5 295 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CPA6Q8N4T0 437 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 KAT5Q92993 513 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-209ENST00000522928 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms