RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SCOCQ9UIL1 159 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.77□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 C1RP00736 705 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 CXADRP78310 365 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ANO4Q32M45 955 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZNX1 250 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 BOD1Q96IK1 185 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.76□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 WNT10BO00744 389 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 FGFR4P22455 802 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 GCSHP23434 173 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 GUCY1A2P33402 732 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ALDH1A3P47895 512 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 CASS4Q9NQ75 786 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 TMEM140Q9NV12 185 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.75□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 TEX33O43247 280 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ENDOD1O94919 500 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 GPANK1O95872 356 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 CDK4P11802 303 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 GYS2P54840 703 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ZNF529Q6P280 563 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 KCNK18Q7Z418 384 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 CMIPQ8IY22 773 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ORAI2Q96SN7 254 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ADI1Q9BV57 179 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.74□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 BRINP1O60477 761 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SOX5P35711 763 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 HSD11B2P80365 405 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 PPP3CAQ08209 521 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 NOMO1Q15155 1222 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 STON2Q8WXE9 905 aa6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SLC6A2P23975 617 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 MCAMP43121 646 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SCAND1P57086 179 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 MALLQ13021 153 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 TOR2AQ5JU69 321 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 UBR7Q8N806 425 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 LDAHQ9H6V9 325 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SGCE-211ENST00000522045 ALAS1P13196 640 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FPR1P21462 350 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 RARRES1P49788 294 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SLC5A3P53794 718 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FAPQ12884 760 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CYP2A13Q16696 494 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 USP25Q9UHP3 1055 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 DMTF1Q9Y222 760 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.71□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 GPR32O75388 356 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 IGLV2-14P01704 120 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MGAT2Q10469 447 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 NACC2Q96BF6 587 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 CCDC78A2IDD5 438 aa6.69□□□□□ -1.34
SGCE-211ENST00000522045 MYADML2A6NDP7 307 aa6.69□□□□□ -1.34
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