RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 ATL3Q6DD88 541 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 C3orf58Q8NDZ4 430 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 DHX58Q96C10 678 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 STRA6Q9BX79 667 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.39■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.38■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 MYBP10242 640 aa15.38■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 CEP57Q86XR8 500 aa15.38■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 TTC26A0AVF1 554 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 LOC730098B7Z3J9 87 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 I3L4J1 428 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 PODXLO00592 558 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 OGTO15294 1046 aa15.37■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 BRCC3P46736 316 aa15.37■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 ITIH3Q06033 890 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 TMC5Q6UXY8 1006 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 PALB2Q86YC2 1186 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.37■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.37■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 KBTBD4Q9NVX7 518 aa15.37■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 ADAM12O43184 909 aa15.36■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 SPATA31D3P0C874 917 aa15.36■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 RESP18Q5W5W9 173 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa15.36■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 HPS3Q969F9 1004 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 HVCN1Q96D96 273 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 CUEDC2Q9H467 287 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 POMKQ9H5K3 350 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 SFXN1Q9H9B4 322 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 MAN1C1Q9NR34 630 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 STYXL1Q9Y6J8 313 aa15.36■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 GCNT3O95395 438 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 ADSSP30520 456 aa15.35■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 ACOT2P49753 483 aa15.35■□□□□ 0.05
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PDGFRB-202ENST00000517488 ZBTB6Q15916 424 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 PSMD5Q16401 504 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 KYAT1Q16773 422 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 ADALQ6DHV7 355 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 LILRA6Q6PI73 481 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 RNF135Q8IUD6 432 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-202ENST00000517488 KIF12Q96FN5 646 aa15.35■□□□□ 0.05
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