RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517173.1

RN7SKP234-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 234, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP234, Length 224 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP234-201ENST00000517173 ACTR2P61160 394 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 TMF1P82094 1093 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 FSTL1Q12841 308 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MYBPC3Q14896 1274 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 NOMO1Q15155 1222 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 ASIC2Q16515 512 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 FDX2Q6P4F2 183 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MILR1Q7Z6M3 343 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 CARNMT1Q8N4J0 409 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 TEX9Q8N6V9 391 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 LRRC46Q96FV0 321 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 TWNKQ96RR1 684 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 TDP1Q9NUW8 608 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 GGA1Q9UJY5 639 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 TBX20Q9UMR3 447 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 X6R8D5 127 aa4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP234-201ENST00000517173 LMTK3Q96Q04 1460 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 MYPNQ86TC9 1320 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CDC14CA4D256 554 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 C22orf46C9J442 243 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 M0R082 166 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CHL1O00533 1208 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 FCHO1O14526 889 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CPLX1O14810 134 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SPTLC2O15270 562 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 TSPAN9O75954 239 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 ACTL6BO94805 426 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 WISP1O95388 367 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 AVPP01185 164 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 PRLP01236 227 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 TK1P04183 234 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CELA3BP08861 270 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 RXRAP19793 462 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 KIF5BP33176 963 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 PRKAA2P54646 552 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 EPHA5P54756 1037 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CDC42EP1Q00587 391 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SLC6A3Q01959 620 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 PPP3CAQ08209 521 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 ACVR2BQ13705 512 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 ISM2Q6H9L7 571 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 ACAD11Q709F0 780 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 CATSPER4Q7RTX7 472 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 NBPF11Q86T75 865 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP234-201ENST00000517173 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms