RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC3P53804 2025 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZANQ9Y493 2812 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC171Q6TFL3 1326 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FANCIQ9NVI1 1328 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 DOCK8Q8NF50 2099 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRR19A6NJB7 356 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FIGNL2A6NMB9 653 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CHL1O00533 1208 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOP56O00567 594 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PPFIA4O75335 1185 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CER1O95813 267 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNA2P01563 188 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRNA1P02708 482 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 URODP06132 367 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31D3P0C874 917 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF883P0CG24 379 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGFR1P11362 822 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 EEF2P13639 858 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGFR2P21802 821 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CALML3P27482 149 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTHP32929 405 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 GUCY1A2P33402 732 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 AK2P54819 239 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRC55Q6ZSA7 311 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC30AQ86WT1 665 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIRT2Q8IXJ6 389 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MORC4Q8TE76 937 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP33Q8TEY7 942 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 HTR3CQ8WXA8 447 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 ING5Q8WYH8 240 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C19orf24Q9BVV8 132 aa2.26□□□□□ -2.05
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM117Q9H0C3 514 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 EHMT1Q9H9B1 1298 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 KANSL2Q9H9L4 492 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP126Q9P2H0 1117 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 SWAP70Q9UH65 585 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 FEM1BQ9UK73 627 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP20Q9Y2K6 914 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDY2AQ9Y6F7 541 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 RYR2Q92736 4967 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PARP14Q460N5 1801 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRBP23467 1997 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PQD8 194 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYBPHLA2RUH7 354 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BRB1 525 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-548P-201ENST00000517083 EYA2O00167 538 aa2.25□□□□□ -2.05
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