RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516970.1

RNU6-182P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 182, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-182P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-182P-201ENST00000516970 SIK3Q9Y2K2 1263 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PROM1O43490 865 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MPGP29372 298 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 HYAL1Q12794 435 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 RASA3Q14644 834 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 GEN1Q17RS7 908 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 Q6ZTC4 211 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TFAP2BQ92481 460 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NRIP3Q9NQ35 241 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 FAM30AQ9NZY2 134 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 HSFX1Q9UBD0 423 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 KAT6AQ92794 2004 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PRSS38A1L453 326 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ADM5C9JUS6 153 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NRP2O60462 931 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PRAMEF4O60810 478 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 APPP05067 770 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SLC6A2P23975 617 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CTSSP25774 331 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TMEM119Q4V9L6 283 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SLC18B1Q6NT16 456 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 REPS2Q8NFH8 660 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 HMCESQ96FZ2 354 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MARK4Q96L34 752 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 GMLQ99445 158 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 VPS33BQ9H267 617 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PRDM12Q9H4Q4 367 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TOMM22Q9NS69 142 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 OXSMQ9NWU1 459 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ZNF112Q9UJU3 913 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 KDM2BQ8NHM5 1336 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SERINC4A6NH21 518 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 LINC00473A8K010 186 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CD1AP06126 327 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SRGNP10124 158 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CRHR1P34998 444 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 LRRC32Q14392 662 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 UBXN2BQ14CS0 331 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CEP78Q5JTW2 689 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 SLC2A7Q6PXP3 512 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ZZZ3Q8IYH5 903 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 COLGALT2Q8IYK4 626 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TMEM79Q9BSE2 394 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MDFICQ9P1T7 246 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PRSS50Q9UI38 385 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 WDR27A2RRH5 827 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CBX4O00257 560 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PPP6CO00743 305 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 XPAP23025 273 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MT3P25713 68 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CERS1P27544 350 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NRG3P56975 720 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 RAP2BP61225 183 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 FHL3Q13643 280 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PTPRRQ15256 657 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 RASAL3Q86YV0 1011 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 GLB1L2Q8IW92 636 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 HAPLN3Q96S86 360 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NUMBLQ9Y6R0 609 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TRGV11A0A075B6L2 103 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 LCHNA4D1U4 455 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 UNCXA6NJT0 531 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 VWC2LB2RUY7 222 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TISP43B9A030 160 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 KRT86O43790 486 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ORC4O43929 436 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 GATA3P23771 443 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 CANXP27824 592 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 KRT81Q14533 505 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 ZNF460Q14592 562 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 TXNRD1Q16881 649 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 PROSER3Q2NL68 480 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-182P-201ENST00000516970 DRC7Q8IY82 874 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms