RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		Q9Y3F1	56 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYH11	P35749	1972 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PTPRJ	Q12913	1337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A087WZ62	844 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HAS3	O00219	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	OGT	O15294	1046 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TADA3	O75528	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MOCS3	O95396	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	VNN1	O95497	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ALDH1A1	P00352	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	F2	P00734	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GJB1	P08034	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRLR	P16471	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNNI1	P19237	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP2B6	P20813	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMOD1	P28289	359 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTGF	P29279	349 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP2C19	P33261	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TNFSF9	P41273	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PHKA2	P46019	1235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IGBP1	P78318	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDC42EP1	Q00587	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GCNT1	Q02742	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CRHR2	Q13324	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SURF1	Q15526	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	GRIK4	Q16099	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CCL14	Q16627	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SHC3	Q92529	594 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TSC1	Q92574	1164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KAT2B	Q92831	832 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	KAT5	Q92993	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	TATDN2	Q93075	761 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZIC5	Q96T25	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATP2C1-223	ENST00000515854	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPR25	O00155	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	B4GALT5	O43286	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZEB2	O60315	1214 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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