RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 KCNK18Q7Z418 384 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 DTWD2Q8NBA8 298 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 GPR152Q8TDT2 470 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 DRC1Q96MC2 740 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 UROC1Q96N76 676 aa18.57■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.57■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa18.57■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.57■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 VWA8A3KMH1 1905 aa18.57■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SFI1A8K8P3 1242 aa18.56■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.56■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.56■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 PARM1Q6UWI2 310 aa18.55■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 FGF13Q92913 245 aa18.55■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 FGF14Q92915 247 aa18.55■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.55■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A7Q9NVC3 462 aa18.55■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.55■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TRIP11Q15643 1979 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PRR23AA6NEV1 266 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ABLIM1O14639 778 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A4O15374 487 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 MCF2P10911 925 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PROZP22891 400 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ITFG1Q8TB96 612 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SNX27Q96L92 541 aa18.54■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.54■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.54■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 POU2F2P09086 479 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
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HERC3-211ENST00000513325 GUCY2CP25092 1073 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RABEP1Q15276 862 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PNMA5Q96PV4 448 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PLIN2Q99541 437 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 TIPINQ9BVW5 301 aa18.53■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 GPC5P78333 572 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SPECC1Q5M775 1068 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 RTL10Q7L3V2 364 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 CNTN3Q9P232 1028 aa18.52■□□□□ 0.56
HERC3-211ENST00000513325 VWA3AA6NCI4 1184 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 PLS3P13797 630 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 RPL9P32969 192 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ROR1Q01973 937 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 STRN3Q13033 797 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SEZ6Q53EL9 994 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 HYIQ5T013 277 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 MTSS1LQ765P7 747 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa18.51■□□□□ 0.55
HERC3-211ENST00000513325 ZNF461Q8TAF7 563 aa18.51■□□□□ 0.55
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