RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511754.5

TNPO1-208, Transcript of transportin 1, human

TSL 5

Gene TNPO1, Length 433 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO1-208	ENST00000511754	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	MAST3	O60307	1309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754		A0A1B0GTW7	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TEX33	O43247	280 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ENDOD1	O94919	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TYRP1	P17643	537 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	SLC5A3	P53794	718 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	C21orf58	P58505	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	GPANK1	O95872	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	SREBF1	P36956	1147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	PLA2G5	P39877	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	MPL	P40238	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	MALL	Q13021	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TOR2A	Q5JU69	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754		Q96MF0	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ORAI2	Q96SN7	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TLDC2	A0PJX2	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CLSTN1	O94985	981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ELANE	P08246	267 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	ALAS1	P13196	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	GCSH	P23434	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CXADR	P78310	365 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	OCA2	Q04671	838 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	STAT4	Q14765	748 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TNPO1-208	ENST00000511754	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	CKB	P12277	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	FGFR4	P22455	802 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	HSD3B2	P26439	372 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	MCAM	P43121	646 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	HSD11B2	P80365	405 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754		Q6ZNX1	250 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	LDAH	Q9H6V9	325 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	GPR32	O75388	356 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	C1R	P00736	705 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	MASP1	P48740	699 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	CREM	Q03060	361 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	MGAT2	Q10469	447 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	SCAP	Q12770	1279 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TNPO1-208	ENST00000511754	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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