RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 IDEP14735 1019 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP1P29466 404 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ME1P48163 572 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ADHFE1Q8IWW8 467 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 HPS3Q969F9 1004 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 STRA6Q9BX79 667 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 TADA2AO75478 443 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNE1P15382 129 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 UPP1Q16831 310 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 RESP18Q5W5W9 173 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GJD3Q8N144 294 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 STK39Q9UEW8 545 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM50BQ9Y247 325 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRC2P26717 231 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 BRCC3P46736 316 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 USP41Q3LFD5 358 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 TNMDQ9H2S6 317 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0B4J269 797 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PODXLO00592 558 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GCNT3O95395 438 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GAP43P17677 238 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GUCY2FP51841 1108 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP57Q86XR8 500 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL18Q96ME1 805 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM9Q9C026 710 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 PANK4Q9NVE7 773 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 NOTCH4Q99466 2003 aa20.39■□□□□ 0.86
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 TTC26A0AVF1 554 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 OGTO15294 1046 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM12O43184 909 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GAT3O94766 335 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ADH1AP07327 375 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31D3P0C874 917 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ATL3Q6DD88 541 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 UROC1Q96N76 676 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 TTPALQ9BTX7 342 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 POMKQ9H5K3 350 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP45Q9UL16 551 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO10Q9HD67 2058 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 LACTBL1A8MY62 500 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 NFICP08651 508 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 CLTAP09496 248 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 SCP2P22307 547 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ADSSP30520 456 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ACOT2P49753 483 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 ASIC1P78348 528 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD5Q16401 504 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PALB2Q86YC2 1186 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 HVCN1Q96D96 273 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PPEF2O14830 753 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 TGM5O43548 720 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP2-218ENST00000511185 GLUD1P00367 558 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms