RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CLK2P49760 499 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
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RABGEF1-211ENST00000503687 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 CDHR1Q96JP9 859 aa13.6□□□□□ -0.23
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 22.7
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RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GUA9 196 aa13.58□□□□□ -0.24
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RABGEF1-211ENST00000503687 SAT1P21673 171 aa13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
RABGEF1-211ENST00000503687 LMNB2Q03252 620 aa13.58□□□□□ -0.24
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