RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNJ6P48051 423 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NT5C2P49902 561 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMC2Q13753 1193 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLFN13Q68D06 897 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DESI2Q9BSY9 194 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PRO3102Q9H379 93 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ACBD3Q9H3P7 528 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TPK1Q9H3S4 243 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BTBD7Q9P203 1132 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 IPPQ9Y573 584 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DOCK1Q14185 1865 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OTOFQ9HC10 1997 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF10AO00220 468 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K7O43318 606 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NPPAP01160 153 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 APOEP02649 317 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GRK2P25098 689 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RUNX1T1Q06455 604 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BFSP2Q13515 415 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf60Q5U649 245 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 Q7L0L9 218 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BRAPQ7Z569 592 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D21Q8IYX1 336 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SDR42E1Q8WUS8 393 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF606Q8WXB4 792 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA6BQ9H3T3 888 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OCEL1Q9H607 264 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 EHMT1Q9H9B1 1298 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF148Q9UQR1 794 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM50BQ9Y247 325 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPN7Q9Y6W3 813 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO1FO00160 1098 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB39O15060 712 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0355O15063 1070 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5F1O95221 314 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTT2P0CG29 244 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTT2BP0CG30 244 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 AKR1B1P15121 316 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF3P17036 446 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CPT1AP50416 773 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGDIBP52566 201 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ACLYP53396 1101 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFAIP2Q03169 654 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ACVR2BQ13705 512 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LETM2Q2VYF4 491 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM47CQ5HY64 1035 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PEX13Q92968 403 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 KLC4Q9NSK0 619 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO10Q9NW15 660 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 THEGQ9P2T0 379 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PYCARDQ9ULZ3 195 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH13Q9UKX3 1938 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 VWA5AO00534 786 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ENPP3O14638 875 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM127O75204 238 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP4AP20648 1035 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V1E1P36543 226 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CD97P48960 835 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 SARSP49591 514 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 PLCD1P51178 756 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 STAT2P52630 851 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 MTTPP55157 894 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-213ENST00000496055 TUBA4AP68366 448 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms