RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6BA6NDN3 693 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF623O75123 536 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 HK1P19367 917 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSWP56202 376 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 RAP2BP61225 183 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 TLE1Q04724 770 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PLP2Q04941 152 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GRM3Q14832 879 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 RAB39AQ14964 217 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CSRP2Q16527 193 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZSN1 163 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DENND1CQ8IV53 801 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF169Q8NCN4 708 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DNERQ8NFT8 737 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CXorf38Q8TB03 319 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MPHOSPH9Q99550 1183 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CGRRF1Q99675 332 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MRI1Q9BV20 369 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 OBP2AQ9NY56 170 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC23A1Q9UHI7 598 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 HDAC5Q9UQL6 1122 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 NR2E3Q9Y5X4 410 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF21BO75037 1637 aa4.18□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 A6NNZ2 444 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CAPN14A8MX76 684 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 B5MCH6 92 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ERC2O15083 957 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX33O43247 280 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 UBXN7O94888 489 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5JP18859 108 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 COMTP21964 271 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 HK3P52790 923 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CTXN1P60606 82 aa4.18□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 SNAPC2Q13487 334 aa4.18□□□□□ -1.74
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RABGGTB-211ENST00000489450 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 DOK3Q7L591 496 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM83AQ86UY5 434 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf20Q8ND61 904 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ST8SIA2Q92186 375 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SPON1Q9HCB6 807 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CD248Q9HCU0 757 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 GLI2P10070 1586 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BML4 177 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ESM1 405 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC16A6O15403 523 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 PJA2O43164 708 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GALT2O43825 422 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 MFAP3LO75121 409 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 IPO13O94829 963 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 CD1AP06126 327 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
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