RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF4A	O95239	1232 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFR3	P22607	806 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PAX3	P23760	479 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXA9	P31269	272 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD54L	Q92698	747 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NXPE3	Q969Y0	559 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX27	Q96L92	541 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA32	Q96LK8	384 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PARVG	Q9HBI0	331 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424		F8W810	466 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TGM5	O43548	720 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CLTA	P09496	248 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G5	P39877	138 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NUBP1	P53384	320 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	GPBP1	Q86WP2	473 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIC6	Q96NY7	704 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PLIN2	Q99541	437 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	REEP2	Q9BRK0	252 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	USP20	Q9Y2K6	914 aa		18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM221	A6NGB7	291 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R296	226 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIO	O75962	3097 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	B3GAT3	O94766	335 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ADRB2	P07550	413 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCG1	P19174	1290 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2B	Q00403	316 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TCHH	Q07283	1943 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR3	Q13615	1198 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB33A	Q14088	237 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD5	Q16401	504 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SPECC1	Q5M775	1068 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RTP2	Q5QGT7	225 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	EPSTI1	Q96J88	318 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MAFF	Q9ULX9	164 aa		18.87	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	SYN3	O14994	580 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAK2	O60296	914 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYND10	O75800	440 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP3A5	P20815	502 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CLCNKB	P51801	687 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIN1	Q05586	938 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CD302	Q8IX05	232 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	HVCN1	Q96D96	273 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MTRR	Q9UBK8	725 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX20	Q9UMR3	447 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM13A	O94988	1023 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	STAT6	P42226	847 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MYCT1	Q8N699	235 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP120	Q8N960	986 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ASIC4	Q96FT7	647 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC26	A0AVF1	554 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM6	Q14566	821 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB6	Q15916	424 aa		18.84	■□□□□ 0.61

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