RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT35Q92764 455 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGPAT1Q99943 283 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GINM1Q9NU53 330 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX24Q9Y343 169 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJB6O95452 261 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLTPP55058 493 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XKR3Q5GH77 459 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLRP4Q96MN2 994 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7ERI5 159 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPR162Q16538 588 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT71Q3SY84 523 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A3Q8WY07 619 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGD4Q96M96 766 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBE4BO95155 1302 aa16.62■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOP56O00567 594 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FDX1P10109 184 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCN3P51790 818 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP24A1Q07973 514 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIFAP3Q92845 792 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHRNB2P17787 502 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPSQ13938 189 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ERO1BQ86YB8 467 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HES6Q96HZ4 224 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALG6Q9Y672 507 aa16.61■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B4GALT5O43286 388 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF844Q08AG5 666 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CETN1Q12798 172 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT39Q6A163 491 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C18orf8Q96DM3 657 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GINS2Q9Y248 185 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARID2Q68CP9 1835 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOCS7O14512 581 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP2A1O14983 1001 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP2C2O75185 946 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM253P0C7T8 217 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DR1Q01658 176 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ORC1Q13415 861 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP57Q86XR8 500 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPD1LQ8N335 351 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHST13Q8NET6 341 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA33Q96N06 139 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB20Q9NX57 234 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPC6Q9Y210 931 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.6■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CUL1Q13616 776 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF149Q8NC42 400 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC45Q96CN5 670 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STRN3Q13033 797 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEDD9Q14511 834 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXL13Q8NEE6 735 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCPH1Q8NEM0 835 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNBP1Q96RU3 617 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MMP19Q99542 508 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NENFQ9UMX5 172 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC188H7C350 402 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF286BP0CG31 522 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD58P19256 250 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNJ1P48048 391 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms