RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477486.1

RBMS1-211, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene RBMS1, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 I3L4J1 428 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 SLC12A3P55017 1021 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 BICD1Q96G01 975 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 AK8Q96MA6 479 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 MYADMQ96S97 322 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.09■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 STK25O00506 426 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 ADAM12O43184 909 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 C8AP07357 584 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 FGFR3P22607 806 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 FSHRP23945 695 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 BRCC3P46736 316 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.08■■□□□ 1.45
RBMS1-211ENST00000477486 MYH11P35749 1972 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 H0YCG3 227 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 CCL16O15467 120 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 CLDN3O15551 220 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 XYLBO75191 536 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 TOM1L1O75674 476 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 BMP15O95972 392 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 TCF15Q12870 199 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 RAB33AQ14088 237 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 BRAPQ7Z569 592 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SNX27Q96L92 541 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 EPS15L1Q9UBC2 864 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.07■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 PODXLO00592 558 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 CFHP08603 1231 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 LAMP2P13473 410 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 RFX1P22670 979 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 PROZP22891 400 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SEZ6Q53EL9 994 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 XKR4Q5GH76 650 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 GPBP1Q86WP2 473 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SLC44A3Q8N4M1 653 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 NXPE3Q969Y0 559 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 MTRRQ9UBK8 725 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 KMT2EQ8IZD2 1858 aa24.06■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 H0Y858 1186 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SLC26A4O43511 780 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 FAM13AO94988 1023 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 KCNE1P15382 129 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 NUBP1P53384 320 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ARPP19P56211 112 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ZPBP2Q6X784 338 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SIX5Q8N196 739 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 MYCT1Q8N699 235 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 TMEM105Q8N8V8 129 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 PHOX2BQ99453 314 aa24.05■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 PDCP20941 246 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 CLCN5P51795 746 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 NTHL1P78549 312 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 UVSSAQ2YD98 709 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ARSHQ5FYA8 562 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 FAM86C1Q9NVL1 165 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 CNTN3Q9P232 1028 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.04■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ABLIM1O14639 778 aa24.03■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 PAPLNO95428 1278 aa24.03■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 ELF1P32519 619 aa24.03■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 LIG4P49917 911 aa24.03■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RBMS1-211ENST00000477486 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms