RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 TNNI1P19237 187 aa28.02■■■□□ 2.08
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SOBP-202ENST00000477448 SLC10A6Q3KNW5 377 aa28.02■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 ZNF516Q92618 1163 aa28.02■■■□□ 2.08
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SOBP-202ENST00000477448 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.02■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.02■■■□□ 2.08
SOBP-202ENST00000477448 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.02■■■□□ 2.08
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SOBP-202ENST00000477448 MXI1P50539 228 aa28.02■■■□□ 2.08
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SOBP-202ENST00000477448 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa28.01■■■□□ 2.07
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SOBP-202ENST00000477448 CDH23Q9H251 3354 aa28.01■■■□□ 2.07
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SOBP-202ENST00000477448 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
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SOBP-202ENST00000477448 SNX27Q96L92 541 aa27.99■■■□□ 2.07
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SOBP-202ENST00000477448 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 HACE1Q8IYU2 909 aa27.96■■■□□ 2.07
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SOBP-202ENST00000477448 APBB2Q92870 758 aa27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 TIFAQ96CG3 184 aa27.96■■■□□ 2.07
SOBP-202ENST00000477448 NUP58Q9BVL2 599 aa27.96■■■□□ 2.07
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