RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475060.1

CTPS1-207, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 813 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-207ENST00000475060 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 WDR49Q8IV35 697 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PRELID2Q8N945 189 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 RDH13Q8NBN7 331 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TCP11Q8WWU5 503 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZIM3Q96PE6 472 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ERP44Q9BS26 406 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GOLPH3Q9H4A6 298 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MROH8Q9H579 483 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC19Q9H756 370 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NFU1Q9UMS0 254 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CSADQ9Y600 493 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GRIN2DO15399 1336 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 COL1A2P08123 1366 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 K7ERI5 159 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ASAP2O43150 1006 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 B4GALT4O60513 344 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TOM1L1O75674 476 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 HLA-DRAP01903 254 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 EDN1P05305 212 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MMEP08473 750 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PAEPP09466 180 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FAM153BP0C7A2 387 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ITGA4P13612 1032 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ABCB4P21439 1286 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 COMTP21964 271 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PTPN7P35236 360 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 STAT5BP51692 787 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NOMO3P69849 1222 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CNTN2Q02246 1040 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 BIRC3Q13489 604 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FAM153CQ494X1 144 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MTERF2Q49AM1 385 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TTMPQ5BVD1 217 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 LRRC38Q5VT99 294 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CROCCP2Q86T23 111 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 C3orf20Q8ND61 904 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 DEPTORQ8TB45 409 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 GPR20Q99678 358 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NUP85Q9BW27 656 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 PLVAPQ9BX97 442 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 FZD8Q9H461 694 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TMBIM4Q9HC24 238 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-207ENST00000475060 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms