RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 MAP2K7O14733 419 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 MAPK13O15264 365 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 OGTO15294 1046 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 SASH3O75995 380 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 CDK17Q00537 523 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 GPS2Q13227 327 aa20.12■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 KRT86O43790 486 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.09■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 GHRP10912 638 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 MYL7Q01449 175 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPN3-209ENST00000466222 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 RNF19AQ9NV58 838 aa20.08■□□□□ 0.81
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CAPN3-209ENST00000466222 FNBP1Q96RU3 617 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 SIX2Q9NPC8 291 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 ANO9A1A5B4 782 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 RPS6KA5O75582 802 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 MCF2P10911 925 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 CKBP12277 381 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 WDR93Q6P2C0 686 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 KIAA1328Q86T90 577 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 LMO3Q8TAP4 145 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPN3-209ENST00000466222 TAS1R2Q8TE23 839 aa20.07■□□□□ 0.8
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