RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CNTN3Q9P232 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ANK1P16157 1881 aa22.34■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 TNFRSF10AO00220 468 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KCNE1P15382 129 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CLCNKBP51801 687 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CES5AQ6NT32 575 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KIF12Q96FN5 646 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 B3GALT6Q96L58 329 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM9Q9C026 710 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.33■■□□□ 1.17
SCAF8-204ENST00000461219 VWA8A3KMH1 1905 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 A0A0B4J269 797 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1B0GVL5 298 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 MYBP10242 640 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CMA1P23946 247 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TNFSF9P41273 254 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 DSG1Q02413 1049 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 NAB2Q15742 525 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 XKR4Q5GH76 650 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TTPALQ9BTX7 342 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM206Q9H813 350 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 DPP7Q9UHL4 492 aa22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PODXLO00592 558 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PFKFB1P16118 471 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PDXDC1Q6P996 788 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 USP25Q9UHP3 1055 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.31■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GLUD1P00367 558 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 EPCAMP16422 314 aa22.3■■□□□ 1.16
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SCAF8-204ENST00000461219 SYKP43405 635 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ACOT2P49753 483 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SPAG1Q07617 926 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 UPP1Q16831 310 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CD302Q8IX05 232 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PRKAG3Q9UGI9 489 aa22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 NCOR1O75376 2440 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 LACTBL1A8MY62 500 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TISP43B9A030 160 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TEX28O15482 410 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PPP1R37O75864 691 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SLFN14P0C7P3 912 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 MCM4P33991 863 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CASP5P51878 434 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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SCAF8-204ENST00000461219 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 UNC13DQ70J99 1090 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 FSIP1Q8NA03 581 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CHST7Q9NS84 486 aa22.29■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TTC26A0AVF1 554 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CLCN4P51793 760 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ITIH3Q06033 890 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 KCNA1Q09470 495 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 KCNC3Q14003 757 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.28■■□□□ 1.16
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