RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460605.1

GTPBP1-204, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-204	ENST00000460605	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	SMARCD2	Q92925	531 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	UROC1	Q96N76	676 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GTPBP1-204	ENST00000460605	COL4A3	Q01955	1670 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		11.96	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	N4BP3	O15049	544 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ADAM12	O43184	909 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	B3GAT3	O94766	335 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CHRNB1	P11230	501 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	GDI1	P31150	447 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	FNTB	P49356	437 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SATB1	Q01826	763 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	GRM2	Q14416	872 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	AMHR2	Q16671	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605		Q6ZUG5	572 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	BRF1	Q92994	677 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CORO1B	Q9BR76	489 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	MAFF	Q9ULX9	164 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CEBPB	P17676	345 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCNE1	P24864	410 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ARL2	P36404	184 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	PTGDR	Q13258	359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CAPS	Q13938	189 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	NTRK3	Q16288	839 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TPH2	Q8IWU9	490 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605		H7C4K7	107 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CPLX1	O14810	134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TM4SF5	O14894	197 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	B4GALT5	O43286	388 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC37A4	O43826	429 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	DEXI	O95424	95 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ATF2	P15336	505 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	XBP1	P17861	261 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	FCAR	P24071	287 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM187B	Q17R55	369 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	INF2	Q27J81	1249 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	VIT	Q6UXI7	678 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	NEK8	Q86SG6	692 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	DYDC2	Q96IM9	177 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	RGL1	Q9NZL6	768 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	NOTCH4	Q99466	2003 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDR27	A2RRH5	827 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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