RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 GPR65Q8IYL9 337 aa28.22■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 FEZF2Q8TBJ5 459 aa28.22■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 NECTIN4Q96NY8 510 aa28.22■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 TTPALQ9BTX7 342 aa28.22■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 POMKQ9H5K3 350 aa28.22■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 MAN1C1Q9NR34 630 aa28.22■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 DCXO43602 365 aa28.21■■■□□ 2.11
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CITED1-210ENST00000454225 MYBP10242 640 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 ALADP13716 330 aa28.21■■■□□ 2.11
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CITED1-210ENST00000454225 UPP1Q16831 310 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 SLC10A6Q3KNW5 377 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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CITED1-210ENST00000454225 RIPOR3Q96MK2 946 aa28.21■■■□□ 2.11
CITED1-210ENST00000454225 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.21■■■□□ 2.11
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CITED1-210ENST00000454225 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.2■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 DNAJC19Q96DA6 116 aa28.2■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.2■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 FNIP2Q9P278 1114 aa28.2■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 ATAT1Q5SQI0 421 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 SLC39A4Q6P5W5 647 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 PIK3R5Q8WYR1 880 aa28.19■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 PODXLO00592 558 aa28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 TNFSF9P41273 254 aa28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 PSMD5Q16401 504 aa28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 TBC1D7Q9P0N9 293 aa28.18■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 I3L4J1 428 aa28.17■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 TGM5O43548 720 aa28.17■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 IDEP14735 1019 aa28.17■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 GAP43P17677 238 aa28.17■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 BRCC3P46736 316 aa28.17■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 KCNG4Q8TDN1 519 aa28.16■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 TRAPPC3O43617 180 aa28.15■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 PDXDC1Q6P996 788 aa28.15■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 DHX58Q96C10 678 aa28.15■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 RPL9P32969 192 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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CITED1-210ENST00000454225 LILRA6Q6PI73 481 aa28.14■■■□□ 2.1
CITED1-210ENST00000454225 TMEM130Q8N3G9 435 aa28.14■■■□□ 2.1
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