RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SGSM3Q96HU1 749 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EPN3Q9H201 632 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF146Q9NTX7 359 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA8RI6L899 631 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP9BO43861 1147 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV5-2P06315 115 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 GFAPP14136 432 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC5P62195 406 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD51Q06609 339 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD5Q7Z6J6 570 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPT2O15123 496 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXN1O15353 648 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TDP2O95551 362 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC18A3Q16572 532 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf72Q96LT7 481 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK16Q96T55 309 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 CHP1Q99653 195 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 SP110Q9HB58 689 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM260Q9NX78 707 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 UTYO14607 1347 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-202ENST00000426333 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 A8MXQ7 604 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 F5H6K3 240 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KLRC3Q07444 240 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 INPP5AQ14642 412 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 GRM4Q14833 912 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL8AQ96BM9 186 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC10A4Q96EP9 437 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 IL17RAQ96F46 866 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LXNQ9BS40 222 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 LZTS1Q9Y250 596 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PDXKO00764 312 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT3HO75486 399 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 FCER1AP12319 257 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD17B4P51659 736 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 STX19Q8N4C7 294 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TEKT4Q8WW24 435 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF2CQ99661 725 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AGPAT1Q99943 283 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM9Q9C026 710 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 GGT7Q9UJ14 662 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 KDM1AO60341 852 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 NMT2O60551 498 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 APRTP07741 180 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 OCM2P0CE71 109 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC1A1P43005 524 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGBQ92521 554 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ENO1P06733 434 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 USP11P51784 963 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 AP3M2P53677 418 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 GPSM2P81274 684 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 STX3Q13277 289 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 EPAS1Q99814 870 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3GL3Q99963 347 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms