RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZPBP2Q6X784 338 aa20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF677Q86XU0 584 aa20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLG1Q92896 1179 aa20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.06■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAPK3O43293 454 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MARK3P27448 753 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPB2P35606 906 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM50Q86XT4 487 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPON1Q9HCB6 807 aa20.05■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCM3APO60318 1980 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTLL13PA6NNM8 815 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LGR5O75473 907 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACO1P21399 889 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFNA5P52803 228 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BPIFB4P59827 614 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CUL2Q13617 745 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD2Q14681 263 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEZ6Q53EL9 994 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN3O15551 220 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPOPO43791 374 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSCO60682 206 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA6P17066 643 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DR1Q01658 176 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTMPQ5BVD1 217 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IER5Q5VY09 327 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARL8AQ96BM9 186 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OPTNQ96CV9 577 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMP19Q99542 508 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.04■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT14P02533 472 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTNNA2P26232 953 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTN2P35609 894 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM189A1O60320 539 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD302Q8IX05 232 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCP11Q8WWU5 503 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAB17Q9H0T7 212 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.03■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF2O75151 1096 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOM1L1O75674 476 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLTAP09496 248 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYGMP11217 842 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSBPP22059 807 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN26Q16670 478 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC45Q96CN5 670 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPH5Q9H2P9 285 aa20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFSF9P41273 254 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CENPCQ03188 943 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLCB4Q15147 1175 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC71Q8N4P6 559 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRELID2Q8N945 189 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF149Q8NC42 400 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA33Q96N06 139 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UMODL1Q5DID0 1318 aa20.01■□□□□ 0.79
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms