RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF577Q9BSK1 485 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL14Q9P2G3 628 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF35A5YM69 484 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 HGSO14964 777 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN3O15551 220 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ENTPD3O75355 529 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 BRAFP15056 766 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CETN1Q12798 172 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC5CO95185 931 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CHKAP35790 457 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX1Q13596 522 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ECHDC2Q86YB7 292 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MAGEB18Q96M61 343 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD27Q96NW4 1050 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ETNK1Q9HBU6 452 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 KCND2Q9NZV8 630 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PSME4Q14997 1843 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MTA2O94776 668 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 STX2P32856 288 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP55Q53EZ4 464 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC174Q6PII3 467 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PPM1KQ8N3J5 372 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC16A10Q8TF71 515 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF653Q96CK0 615 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 WHRNQ9P202 907 aa19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 LINGO3P0C6S8 592 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ECE1P42892 770 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 FMO1Q01740 532 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT17Q04695 432 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ACVR2BQ13705 512 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MTFR1Q15390 333 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 DLGAP5Q15398 846 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 KREMEN1Q96MU8 473 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SH2D3AQ9BRG2 576 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PKD2L1Q9P0L9 805 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 GNAZP19086 355 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 RWDD2BP57060 319 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 RASA3Q14644 834 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 RHBDF2Q6PJF5 856 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PADI6Q6TGC4 694 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM71AQ8IYT1 594 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP120Q8N960 986 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MORC4Q8TE76 937 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG4AQ8WYN0 398 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ELMO3Q96BJ8 720 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM117Q9H0C3 514 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFATQ9P243 1243 aa19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC4O95801 387 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 GZMAP12544 262 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MXI1P50539 228 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 STAT2P52630 851 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP4X1Q8N118 509 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX9Q8N6V9 391 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 FBF1Q8TES7 1133 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC19Q9H756 370 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TXLNGQ9NUQ3 528 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPBP1Q9NZL4 362 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ASIC3Q9UHC3 531 aa19.53■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR2MP0CAP2 368 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SGO2Q562F6 1265 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 YIPF3Q9GZM5 350 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CHST7Q9NS84 486 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ENO4A6NNW6 628 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP1A2P05177 515 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 TAC1P20366 129 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 CXCL9Q07325 125 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP6Q2NL67 630 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIPAP1Q4V328 841 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 OGFOD1Q8N543 542 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 GRAMD1AQ96CP6 724 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 MYLK2Q9H1R3 596 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 PIM2Q9P1W9 311 aa19.52■□□□□ 0.72
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNRF3Q9ULT6 936 aa19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms