RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 TELO2Q9Y4R8 837 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZHX2Q9Y6X8 837 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-172P-201ENST00000411000 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.46
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADM5C9JUS6 153 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PODXLO00592 558 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR182O15218 404 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PROM1O43490 865 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL6A2P12110 1019 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ECE1P42892 770 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAV2P52735 878 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMS1P54277 932 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFATC2Q13469 925 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 DGKDQ16760 1214 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 AGAP9Q5VTM2 703 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 METRNLQ641Q3 311 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 VWA1Q6PCB0 445 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF584Q8IVC4 421 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF547Q8IVP9 402 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNL3Q8IZI9 196 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP21Q8N119 569 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 RFLNBQ8N5W9 214 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00612Q8N6U2 182 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR56A1Q8NGH5 318 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 GATAD2BQ8WXI9 593 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL20Q96IG2 436 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF599Q96NL3 588 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASB2Q96Q27 587 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 NEU1Q99519 415 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 TM6SF1Q9BZW5 370 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 NIF3L1Q9GZT8 377 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ENKD1Q9H0I2 346 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM8AQ9HCN3 771 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 DENND2AQ9ULE3 1009 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 FZD9O00144 591 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRP1O14786 923 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC16A5O15375 505 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASAP2O43150 1006 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERN1O75460 977 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 URI1O94763 535 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 F7P08709 466 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 NME1P15531 152 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 EN2P19622 333 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP2B4P23634 1241 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLH1P40692 756 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCT8P50990 548 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC8A3P57103 927 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNAB2Q13303 367 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 LSAMPQ13449 338 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCEAL1Q15170 157 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRRQ15256 657 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 TXNRD1Q16881 649 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF774Q6NX45 483 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM64Q6YI46 380 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEF8Q6ZN54 512 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 MORC1Q86VD1 984 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 RHOT2Q8IXI1 618 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 COLGALT2Q8IYK4 626 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DL5AQ8N109 375 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 STK32AQ8WU08 396 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF428Q96B54 188 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO17Q96EF6 278 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHF21BQ96EK2 531 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 NLRP4Q96MN2 994 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 DOCK7Q96N67 2140 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGLYRP2Q96PD5 576 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 RETREG1Q9H6L5 497 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPRC5CQ9NQ84 441 aa-0.36□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms